液質聯用儀主要應用于藥物代謝及藥物動力學研究、臨床藥理學研究、天然藥物（中草藥等）開發研究、新生兒篩選、蛋白與肽類的鑒定、殘留分析、毒物分析、環境分析－環保、食品、自來水、衛生防疫等行業。液質聯用儀的靈敏度高，通量性能好——優異的高流量性能、降低的離子抑制效應、自清潔離子源探針設計和可靠的接口設計，加速了分析速度；使用更簡便。
液質聯用儀利用在線樣品制備技術將分析時間從數天縮短至數分鐘。利用TraceFinder軟件的內置方法簡化分析方法開發過程。利用高分辨準確質量數進行目標與非目標化合物的定量與定性檢測。內置SRM條件適用于農藥，藥物和個人護理產品的分析。離子化接口，直至采用了大氣壓電離（API）技術之后，才發展成為可常規應用的重要分離分析方法。液質聯用儀中常用有大氣壓電噴霧電離源（ESI）和大氣壓化學電離源（APCI），兩者同屬于大氣壓電離（API）技術，其離子化過程發生在大氣壓下，這與氣質中采用在真空下電離的技術有本質不同。
液質聯用儀功能用途,將液質聯用儀與質譜儀耦合到一起，有機混合物通過液相色譜儀分離后依次進入質譜儀進行檢測。用于未知化合物的結構分析和定量，臨床、法醫、毒理、天然產物分析，蛋白質組學、生物大分子測定等。
液質聯用儀它在許多方面采用了新的設計，比如四極桿、真空系統、質譜的倍增器、電離源位置等等，得到性能好但體積小的液質聯用儀，具有子離子掃描、母離子掃描、中性丟失掃描和MS/MS掃描功能，對于目標化合物分析、藥物代謝分析、新生兒篩選、農藥農殘、環境污染分析等提供高靈敏度和選擇性的分析手段。豐富的知識,核心的體會.
